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Cyclomarin A

MCE 国际站：Cyclomarin A

品牌：MedChemExpress (MCE)

货号：HY-P6300

CAS 号：169062-92-4

生物活性：环马林A是一种抗菌剂，对结核分枝杆菌ClpC1的Kd值为2.3 nM，对ClpC2的Kd值为2.2 nM，对恶性疟原虫PfAp3Aase的IC50值为0.004 μM。环马林A与ClpC1的N端结构域结合，刺激其ATPase活性和蛋白水解活性，导致蛋白水解失调，并诱导蛋白质组失衡；它还能与ClpC2结合并上调其转录水平。环马林A以二聚体形式与PfAp3Aase结合，阻断底物结合途径，抑制红细胞期恶性疟原虫的生长，且对人细胞无活性。环马林A对多种癌细胞系表现出中等程度的细胞毒性。 Cyclomarin A 可作为 Homo-BacPROTAC 开发的先导化合物。Cyclomarin A 适用于结核病和疟疾相关研究[1][2][3][4][5]。

体外研究(In Vitro)：OthersAnti-cancerParasitic InfectionBacterial Infection Others Cyclomarin A 结合于结核分枝杆菌 ClpC1NTD 上一个保守的疏水口袋，该口袋是错误折叠蛋白的受体位点[1]。Cyclomarin A (0.01-25 μM) 可强效激活嵌合蛋白 NMtb-ClpC 的 ATP 酶活性，其 K0.5 为 0.3 μM；可部分激活 Sa ClpC-Y80F，而对 Sa ClpC 野生型无作用[4]。Cyclomarin A (0.1-25 μM) 可使 NMtb-ClpC/Sa ClpP 不依赖衔接蛋白降解 FITC-酪蛋白，其半最大活性对应的浓度为 0.13 μM；该物质可导致 Sa ClpC-Y80F/Sa ClpP 发生部分降解，但对野生型 Sa ClpC/Sa ClpP 无影响[4]。Cyclomarin A (10 μM) 可激活 NMtb-ClpC/Sa ClpP，以降解未标记的酪蛋白和天然底物 FtsZ，并抑制该复合物对 MecA 的降解[4]。Cyclomarin A (10 μM) 可激活 NMtb-ClpC/Sa ClpP 以降解稳定折叠底物 Casein-YFP 和 GFP-SsrA，但与 MecA 激活相比，其解折叠能力显著降低[4]。Cyclomarin A (20 μM) 可诱导 NMtb-ClpC-DWB 形成由多个六聚体组成的大型均一 24.2 聚体组装体，该组装体能够与 Sa ClpP 相互作用[4]。Cyclomarin A (20 μM; 10 min) 可诱导 NMtb-ClpC 发生构象变化，该变化与 MecA 诱导的构象变化高度相似，包括 ATP 结合及水解相关关键结构域的稳定性增强[4]。 Anti-cancer Cyclomarin A 对多种癌细胞系表现出中等细胞毒性，其 IC50 为 ~2.5 μM[2]。 Parasitic Infection Cyclomarin A 可在纳摩尔浓度范围内选择性抑制恶性疟原虫 (Plasmodium falciparum) 的 PfAp3Ase，且不会抑制人源 FHIT 酶[2]。Cyclomarin A 可抑制恶性疟原虫 NF54 株红细胞期的生长，其 IC50 为 40 nM[3]。Cyclomarin A 可强效抑制重组恶性疟原虫 PfAp3Aase，其 IC50 为 4 nM；且在浓度高达 10 μM 时，不会抑制重组恶性疟原虫 PfAp4Aase 或人源 hFHIT[3]。Cyclomarin A 结合于同源二聚体恶性疟原虫 PfAp3Aase 的中央通道，通过空间位阻阻断底物进入两个结合位点并抑制酶活性[3]。Cyclomarin A (100 μM) 可特异性结合恶性疟原虫 PfAp3Aase，这一点在亲和层析实验中表现为结合竞争率>75%[3]。 Bacterial Infection Cyclomarin A 对结核分枝杆菌 (MTB) 具有抗菌活性[2]。Cyclomarin A 可通过结合 ClpC1 并调控蛋白水解过程，以 0.1 μM 的 MIC50 抑制结核分枝杆菌的生长[3]。Cyclomarin A (0.1-10 μM; 24 h) 对共表达 NMtb-ClpC 与 Sa ClpP 的 E. coli 细胞具有毒性，在 10 μM 浓度下可使细胞活力降低 1000 倍，在 1 μM 浓度下达到最大毒性，其作用机制为对细胞内蛋白的失控性蛋白水解[4]。Cyclomarin A (5 μM) 与纯化的结核分枝杆菌 ClpC2 结合，解离常数为 2.2 nM，表现出紧密的 1:1 结合模式，其亲和力与对 ClpC1 NTD 的亲和力相当[5]。Cyclomarin A (1.1-fold molar excess relative to ClpC294-252) 以与结合 ClpC1 NTD 几乎完全相同的方式结合结核分枝杆菌 Mycobacterium tuberculosis ClpC2 的 C 末端结构域 (94-252 位残基)，这一点由分辨率为 1.43 Å的共晶结构证实[5]。Cyclomarin A (150 nM; up to 100 hours) 可抑制 Mycobacterium smegmatis ΔclpC2 菌株的生长，而野生型菌株和 clpC2 互补菌株则不受影响，这表明 ClpC2 可通过直接结合介导对 CymA 诱导毒性的抗性[5]。Cyclomarin A (150 nM; 1-8 h) 可显著上调耻垢分枝杆菌中 ClpC2 蛋白的表达，处理后 8 小时其表达水平达到稳定表达的 ClpC1 水平的 84 倍[5]。Cyclomarin A (150 nM; 1 h) 可使耻垢分枝杆菌 中 clpC2 的转录水平上调 263 倍[5]。Cyclomarin A (2-20 μM) 刺激的 ClpC1P 对 FITC-酪蛋白的蛋白水解活性会被纯化的结核分枝杆菌 ClpC2 呈剂量依赖性抑制，当 ClpC2 浓度为 20 μM 时抑制作用接近完全[5]。Cyclomarin A (1 μM; 20 min) 可抑制纯化的结核分枝杆菌 ClpC2 与其自身操纵子 DNA 的结合[5]。 MedChemExpress (MCE) has not independently confirmed the accuracy of these methods. 仅供参考。

分子量：1043.30

Formula：C56H82N8O11

运输条件：美国大陆地区的室温；其他地区可能有所不同。

储存方式：请按照分析证书中推荐的条件储存产品。

提供质量检测报告：Data Sheet、产品使用指南

产品活性：Cyclomarin A 是一种抗菌剂，其与结核分枝杆菌 ClpC1 的 Kd 为 2.3 nM，与 ClpC2 的 Kd 为 2.2 nM，与恶性疟原虫 PfAp3Aase 的 IC50 为 0.004 μM。Cyclomarin A 结合 ClpC1 的 N 端结构域，刺激 ATP 酶活性与蛋白水解活性，使蛋白水解作用失调，诱导蛋白质组失衡，同时结合 ClpC2 并上调其转录水平。Cyclomarin A 结合二聚体形式的 PfAp3Aase，阻断底物结合通路，抑制恶性疟原虫红细胞期的生长，且对人类细胞无活性。Cyclomarin A 对多种癌细胞系表现出中等细胞毒性。Cyclomarin A 可作为开发 Homo-BacPROTAC 的母本化合物。Cyclomarin A 可用于结核病和疟疾的相关研究。

IC50 & Target：ClpC2 2.2 nM (Kd)

热门产品线：抑制剂  | 稳定性同位素标记物  |  脂质  |  糖类

Trending products：Inhibitors  | Isotope-Labeled Compounds  |  Lipids  |  Saccharides

MCE 抑制剂:
MedChemExpress (MCE) 提供抑制剂、激动剂、拮抗剂、激活剂、调节剂、降解剂、配体和底物等多种生物活性化合物，可用于靶点功能验证、信号转导机制研究、细胞表型分析、疾病机制研究、药效评价及活性化合物筛选。

MedChemExpress 信号通路产品覆盖细胞凋亡、自噬、细胞周期与 DNA 损伤、表观遗传、GPCR/G 蛋白、免疫与炎症、JAK/STAT、MAPK/ERK、膜转运体与离子通道、代谢酶与蛋白酶、神经信号、NF-κB、PI3K/Akt/mTOR、PROTAC、蛋白酪氨酸激酶/受体酪氨酸激酶、干细胞/Wnt、TGF-β/Smad 及维生素 D/核受体等研究方向，为肿瘤、感染、炎症与免疫、神经系统疾病、代谢性疾病、心血管疾病和内分泌研究提供多维度的产品选择，助力客户发表文献超 80,000 篇。

相关产品可根据具体情况提供化学结构、作用靶点、生物活性、纯度、溶解度、体内外研究信息、参考文献及质量分析报告 (COA)等资料。

客户发表文献：
[1]. Nature. 2026 Sep;657(8131):549-558.
[2]. Nature. 2026 Sep;657(8132):755-764.
[3]. Nature. 2026 Sep;657(8133):1027-1034.
[4]. Nature. 2026 Sep;657(8131):477-486.
[5].Nature. 2026 Sep;657(8132):789-799.
[6]. Nature. 2026 Sep;657(8131):517-524.
[7]. Nature. 2026 Sep;657(8133):1045-1052.
[8]. Cell. 2026 Sep 14:S0092-8674(26)01003-2.
[9]. Cell. 2026 Sep 3;189(18):5688-5705.e13.
[10]. Cell. 2026 Sep 2:S0092-8674(26)00937-2.

参考文献：
[1]. Hoi DM, et al. Clp-targeting BacPROTACs impair mycobacterial proteostasis and survival. Cell. 2023 May 11;186(10):2176-2192.e22.
[2]. Barbie P, et al. Total Synthesis of Cyclomarin A, a Marine Cycloheptapeptide with Anti-Tuberculosis and Anti-Malaria Activity. Organic letters. 2016 Jan 15;18(2):204-7.
[3]. Bürstner N, et al. Gift from Nature: Cyclomarin A Kills Mycobacteria and Malaria Parasites by Distinct Modes of Action. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2015 Nov;16(17):2433-6.
[4]. Maurer M, et al. Toxic Activation of an AAA+ Protease by the Antibacterial Drug Cyclomarin A. Cell Chem Biol. 2019 Aug 15;26(8):1169-1179.e4.
[5]. Taylor G, et al. ClpC2 protects mycobacteria against a natural antibiotic targeting ClpC1-dependent protein degradation. Communications biology. 2023 Mar 21;6(1):301.